More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1742 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  78.41 
 
 		 403 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  93.8 
 
 		 403 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  84.62 
 
 		 403 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  92.8 
 
 		 403 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 403 aa  829    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  75.68 
 
 		 403 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  74.94 
 
 		 405 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  74.44 
 
 		 423 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  74.19 
 
 		 405 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  73.95 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  68.66 
 
 		 404 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  70.32 
 
 		 404 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  70.07 
 
 		 404 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  70.65 
 
 		 406 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  68.83 
 
 		 407 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  64.93 
 
 		 404 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  62.03 
 
 		 408 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  61.94 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  64.18 
 
 		 404 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  60.64 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  60.93 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  58.71 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  59.5 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  59.15 
 
 		 409 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  62 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  58.9 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  59.15 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  57.82 
 
 		 409 aa  488  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  59.4 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  59.15 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  62.69 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  58.6 
 
 		 407 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 		 407 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  58.35 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  59.31 
 
 		 409 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 407 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  58.96 
 
 		 408 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  59.44 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  58.75 
 
 		 406 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  61.15 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  59.51 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  61.19 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  61.94 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  61.94 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  58.96 
 
 		 407 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  58.78 
 
 		 421 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  61.15 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  61.19 
 
 		 414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  62.84 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  58.44 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  57.82 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  59.45 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  52.49 
 
 		 648 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  57.5 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  51.86 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  53.13 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  51.12 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  48.8 
 
 		 608 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  51.13 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  57.47 
 
 		 416 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  53.05 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  47.72 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.03 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  46.15 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.39 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.68 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.32 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.84 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  37.54 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.01 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.36 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.26 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.31 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.24 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.54 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.41 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.08 
 
 		 396 aa  232  9e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.08 
 
 		 396 aa  232  9e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.83 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.33 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.5 
 
 		 393 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.18 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.5 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.75 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.67 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  33.5 
 
 		 395 aa  227  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.67 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.68 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.42 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.42 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.67 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.32 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.06 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.6 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.582044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>