More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0044 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 
408 aa  834    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  62.91 
 
 
416 aa  512  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  56.14 
 
 
406 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  55.53 
 
 
403 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  54.25 
 
 
403 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  57.62 
 
 
404 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  54.64 
 
 
403 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  54.82 
 
 
404 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  55.44 
 
 
407 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  54.45 
 
 
409 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  53.05 
 
 
403 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  56.58 
 
 
408 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  57.36 
 
 
406 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  53.54 
 
 
410 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  54.78 
 
 
406 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  52.99 
 
 
409 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  52.97 
 
 
409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  53.94 
 
 
409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  53.85 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  54.43 
 
 
409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  54.82 
 
 
404 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  54.33 
 
 
404 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  52.33 
 
 
409 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  51.76 
 
 
403 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  52.66 
 
 
409 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  54.66 
 
 
407 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  53.16 
 
 
407 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  54.94 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  53.73 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  52.33 
 
 
409 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  52.71 
 
 
423 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  52.85 
 
 
405 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  53.11 
 
 
405 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  53.42 
 
 
404 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  53.39 
 
 
405 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  51.65 
 
 
403 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  54.07 
 
 
421 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  51.77 
 
 
404 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  50 
 
 
408 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  47.97 
 
 
402 aa  384  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  57.49 
 
 
414 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  57.49 
 
 
433 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  52.62 
 
 
421 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  48.46 
 
 
401 aa  383  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  52.44 
 
 
425 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  55.35 
 
 
414 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  52.7 
 
 
425 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  55.35 
 
 
433 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  50.88 
 
 
648 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  50.51 
 
 
407 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  47.81 
 
 
398 aa  376  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  55.09 
 
 
462 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  53.26 
 
 
425 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  50.63 
 
 
424 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  54.83 
 
 
431 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  50 
 
 
407 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  54.83 
 
 
462 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  54.83 
 
 
462 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  48.84 
 
 
406 aa  369  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  49.61 
 
 
407 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  49.61 
 
 
407 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  50.64 
 
 
425 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  49.61 
 
 
407 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  53.28 
 
 
430 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  51.69 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  48.61 
 
 
608 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  48.71 
 
 
439 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  46.48 
 
 
573 aa  348  8e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  41.94 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  43.41 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.44 
 
 
388 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.89 
 
 
397 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.92 
 
 
397 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3900  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.92 
 
 
397 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.339123  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4104  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.92 
 
 
397 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130063  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 
397 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3992  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 
397 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.061688 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.66 
 
 
391 aa  226  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.49 
 
 
395 aa  225  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.77 
 
 
395 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.49 
 
 
390 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.42 
 
 
397 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 
397 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.42 
 
 
397 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.42 
 
 
397 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.9 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  34.27 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.08 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.84 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.67 
 
 
395 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.38 
 
 
394 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.45 
 
 
381 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.83 
 
 
399 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.03 
 
 
395 aa  219  7e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  34 
 
 
395 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  34 
 
 
395 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  34 
 
 
395 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.45 
 
 
381 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.91 
 
 
397 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>