More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2107 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 414 aa  831    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 433 aa  876    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  81.88 
 
 		 462 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  82.86 
 
 		 431 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  80.92 
 
 		 462 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  87.27 
 
 		 433 aa  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  90.22 
 
 		 414 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  80.92 
 
 		 462 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  72.5 
 
 		 409 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  72.41 
 
 		 409 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  72.75 
 
 		 409 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  73 
 
 		 409 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  71.18 
 
 		 409 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  70.43 
 
 		 409 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  69.65 
 
 		 410 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  73.8 
 
 		 425 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  68.92 
 
 		 409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  68.78 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  68.54 
 
 		 425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  68.37 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  69.33 
 
 		 430 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  64.88 
 
 		 439 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  63.5 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  60.93 
 
 		 408 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  59.65 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  61.19 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 		 404 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  62.2 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  61.69 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  62.47 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  62.47 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  61.44 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  59.85 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  61.52 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  57.82 
 
 		 408 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  62.41 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  61.6 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 407 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 407 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  60.85 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 407 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  58.71 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 406 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  59.35 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  58.62 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  58.46 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  61.11 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  56.93 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  56.68 
 
 		 407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  58.1 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  55.33 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  56.19 
 
 		 424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  56.97 
 
 		 404 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  54.68 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  51.24 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  55.86 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  52.42 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  52.67 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  55.78 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  50.71 
 
 		 648 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  48.87 
 
 		 608 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  55.35 
 
 		 408 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  48.61 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  53.71 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  51.01 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  45.6 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.77 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.06 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  38.62 
 
 		 390 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.15 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.26 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.68 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.58 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.59 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.68 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.11 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.67 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2796  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.78 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.18 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.73 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.73 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  36.34 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.78 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.15 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.38 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.46 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.64 
 
 		 400 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.39 
 
 		 393 aa  223  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.11 
 
 		 391 aa  222  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3992  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.03 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.061688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.48 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.41 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.08 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3900  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.03 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.339123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>