More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3730 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  82.88 
 
 		 423 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  75.68 
 
 		 403 aa  636    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  83.13 
 
 		 405 aa  675    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  83.13 
 
 		 405 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  82.63 
 
 		 405 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  76.43 
 
 		 403 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 403 aa  820    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  76.18 
 
 		 403 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  75.68 
 
 		 403 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  74.69 
 
 		 403 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  70.65 
 
 		 404 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  73.63 
 
 		 406 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  73.07 
 
 		 404 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  72.82 
 
 		 404 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  70.07 
 
 		 407 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  67.41 
 
 		 404 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  63.77 
 
 		 408 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  62.53 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  64.68 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  61.94 
 
 		 408 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  63.5 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  63.16 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  62.19 
 
 		 410 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  62.16 
 
 		 409 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  60.89 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  61.65 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  60.25 
 
 		 406 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  60.4 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  63.22 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 407 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  61.44 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  60.85 
 
 		 407 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  64 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  61.04 
 
 		 407 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  60.35 
 
 		 407 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  58.81 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  61.22 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  58.25 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  64.59 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 407 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  60.4 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  61.88 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  59.29 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  60.65 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  58.77 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  62.38 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  62.38 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  59.06 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  61.14 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  52.85 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  52.88 
 
 		 398 aa  448  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  58.5 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  53.23 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  52.49 
 
 		 648 aa  441  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  51.38 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  50.96 
 
 		 608 aa  440  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  56.89 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  47.48 
 
 		 573 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  51.65 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  48.76 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  47.59 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.84 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.04 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  37.89 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.92 
 
 		 395 aa  229  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.34 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.91 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.82 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.35 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.31 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.78 
 
 		 391 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.48 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.15 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.73 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  33 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  33.08 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.49 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.71 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.2 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02780  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.61 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.16 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.11 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7004  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.69 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4803  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.65 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3792  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.15 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000577388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>