More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4085 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  87.87 
 
 
404 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  85.4 
 
 
406 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  87.38 
 
 
404 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 
404 aa  840    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  69.65 
 
 
403 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  69.9 
 
 
403 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  70.15 
 
 
403 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  71.32 
 
 
407 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  68.41 
 
 
403 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  68.66 
 
 
403 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  70.65 
 
 
403 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  70.05 
 
 
405 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  69.8 
 
 
423 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  70.05 
 
 
405 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  68.81 
 
 
405 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  67.33 
 
 
404 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  66.58 
 
 
404 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  61.14 
 
 
408 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 
408 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  62.16 
 
 
409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  65.19 
 
 
407 aa  515  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  61.14 
 
 
404 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 
410 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  61.25 
 
 
409 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  60.44 
 
 
409 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 
409 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 
409 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  60.65 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 
408 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  61.79 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 
404 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  61.15 
 
 
409 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  58.75 
 
 
406 aa  495  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  61.69 
 
 
434 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  59.75 
 
 
406 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  60.3 
 
 
407 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  60.3 
 
 
407 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 
433 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 
407 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  60.36 
 
 
407 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  60.75 
 
 
425 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  60.1 
 
 
407 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 
414 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 
407 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  59.45 
 
 
425 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  59.21 
 
 
424 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  57.95 
 
 
421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  58.96 
 
 
425 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  59.15 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  57.58 
 
 
421 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  58.71 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 
462 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  59.45 
 
 
430 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  59.85 
 
 
431 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 
462 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  53.98 
 
 
402 aa  451  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  56.33 
 
 
439 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  53.33 
 
 
648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  55.95 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  51.67 
 
 
608 aa  444  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  54.29 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  57 
 
 
435 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  52.91 
 
 
406 aa  437  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  51.08 
 
 
573 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  56.57 
 
 
416 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  54.82 
 
 
408 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.76 
 
 
403 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  41.79 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  38.29 
 
 
390 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.83 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.71 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
399 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
399 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.96 
 
 
399 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.68 
 
 
392 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.96 
 
 
399 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.9 
 
 
394 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.4 
 
 
395 aa  236  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.71 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.18 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.46 
 
 
399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.98 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 
389 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.68 
 
 
395 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.7 
 
 
393 aa  229  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.81 
 
 
397 aa  229  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.54 
 
 
397 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.96 
 
 
395 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.94 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.29 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410368  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1510  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.29 
 
 
399 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0574329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.29 
 
 
451 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.09 
 
 
397 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000130332  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.53 
 
 
393 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3792  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.09 
 
 
406 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000577388  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7004  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.44 
 
 
399 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 
395 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.42 
 
 
397 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>