More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0922 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 409 aa  850    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  81.42 
 
 		 409 aa  708    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  76.77 
 
 		 410 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  93.4 
 
 		 409 aa  799    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  86.06 
 
 		 409 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  93.64 
 
 		 409 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  80.93 
 
 		 409 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  83.37 
 
 		 409 aa  725    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  69.08 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  68.83 
 
 		 425 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  68.3 
 
 		 462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  66.09 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  67.57 
 
 		 462 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  68.97 
 
 		 433 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  67.57 
 
 		 462 aa  557  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  65.59 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  68.72 
 
 		 414 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  68.92 
 
 		 433 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  68.92 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  66.67 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  62.72 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  65.19 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  65 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.44 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  60.3 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  61.15 
 
 		 403 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  57.96 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  60.86 
 
 		 407 aa  498  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  58.73 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  57.92 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  57.46 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 407 aa  491  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  61.15 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  60.4 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  59.9 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  59.4 
 
 		 403 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  60 
 
 		 408 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  59.31 
 
 		 423 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  59.31 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  54.93 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  54.19 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  58.65 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  56.72 
 
 		 408 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  57.74 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  57.14 
 
 		 404 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  56.93 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  51 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  55.25 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  55.25 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  56 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  55.72 
 
 		 421 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  56 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  55.25 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  55.89 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  55.5 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  53.28 
 
 		 406 aa  440  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  51.65 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  51.26 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  53.98 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  51.57 
 
 		 648 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  51.68 
 
 		 608 aa  428  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  53.12 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  49.88 
 
 		 573 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  52.97 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.72 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  48.12 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.4 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.71 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  37.6 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.52 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.26 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.54 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.32 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.77 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.33 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.582044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.11 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.37 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.94 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.71 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.33 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.05 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.84 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.75 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.12 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.83 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.83 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2796  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.72 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 		 395 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.59 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00066  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.57 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.84 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.29 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.82 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.29 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.66 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.29 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>