More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2905 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 408 aa  835    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  66.34 
 
 		 404 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  66.25 
 
 		 406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  64.84 
 
 		 406 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  67.25 
 
 		 407 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  63.68 
 
 		 408 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  64.18 
 
 		 408 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  64.02 
 
 		 409 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  61.62 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  63.28 
 
 		 403 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  63.77 
 
 		 403 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  62.03 
 
 		 403 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 410 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  62.44 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  61.36 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  62.03 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  62.81 
 
 		 434 aa  519  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  60.61 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  61.17 
 
 		 409 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  61.54 
 
 		 403 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  62.94 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  61.27 
 
 		 423 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  63.28 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  62.22 
 
 		 407 aa  508  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  61.29 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  61.79 
 
 		 405 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  59.9 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  61.1 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  61.1 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  60.1 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  58.73 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  60.49 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  61.54 
 
 		 407 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  60.79 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  60.79 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  61.94 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  61.69 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  61.44 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  60.93 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 404 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  59.75 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  59.34 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  58.15 
 
 		 425 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  58.48 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  59.08 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  60.85 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  57.25 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  55.33 
 
 		 439 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  58.21 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  57 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  52.36 
 
 		 402 aa  448  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  52.99 
 
 		 406 aa  451  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  53.13 
 
 		 401 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  52.26 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  54.48 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  51.07 
 
 		 648 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  56.78 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  48.96 
 
 		 608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  53.73 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  46.56 
 
 		 573 aa  393  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  49.75 
 
 		 403 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  45.22 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.68 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.89 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.47 
 
 		 395 aa  245  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.89 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.29 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.87 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.08 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.04 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.86 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.32 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.46 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3756  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.19 
 
 		 397 aa  232  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.399455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3792  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.26 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000577388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.69 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.03 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  36.36 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.93 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.52 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.93 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.83 
 
 		 389 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.82 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0785377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4034  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4095  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.582044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.96 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.53 
 
 		 398 aa  226  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>