More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4023 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 410 aa  838    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  78.24 
 
 		 409 aa  685    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  80.93 
 
 		 409 aa  705    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  79.71 
 
 		 409 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  78 
 
 		 409 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  78.24 
 
 		 409 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  78.24 
 
 		 409 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  76.77 
 
 		 409 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  69.75 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  69.93 
 
 		 425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  69.9 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  69.68 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  68.87 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  69.12 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  69.12 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  69.53 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  69.53 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  69.65 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  68.16 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  69.65 
 
 		 414 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  69.65 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  63.73 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  62.31 
 
 		 406 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  67.08 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  62.25 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  60.3 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  61.44 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  62.59 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 404 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  60.95 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  62.09 
 
 		 404 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  63.48 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  61.48 
 
 		 407 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  62.19 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  58.71 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  58.96 
 
 		 408 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  59.36 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  59.45 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  57.32 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  57.32 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  59.55 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  57.32 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  57.96 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  54.93 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  57.86 
 
 		 404 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  56.72 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  54.19 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  56.23 
 
 		 408 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  56.8 
 
 		 421 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  54.77 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  57.21 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  56.55 
 
 		 421 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  55.97 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  50.12 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  51.62 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  51.25 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  49.52 
 
 		 648 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  47.61 
 
 		 608 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  53.54 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  52.79 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  48.41 
 
 		 573 aa  392  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  46.02 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  46.02 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.5 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.59 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.46 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.35 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.11 
 
 		 395 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  36.21 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.5 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.42 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.51 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.19 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.5 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.98 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.15 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.17 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.54 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.31 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.9 
 
 		 397 aa  225  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.28 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.28 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.28 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.14 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.28 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.01 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.27 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.87 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.77 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.47 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.43 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.65 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.69 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>