More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9236 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 
400 aa  827    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  45.48 
 
 
404 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  49 
 
 
403 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  46.77 
 
 
403 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  45.52 
 
 
403 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  44.53 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  48.41 
 
 
409 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  46.15 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  48.12 
 
 
409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  50.58 
 
 
433 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  44.62 
 
 
407 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  48.12 
 
 
409 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  48 
 
 
403 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  50.43 
 
 
414 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  46.57 
 
 
409 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  45.79 
 
 
421 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  43.73 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  43.73 
 
 
407 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  48.55 
 
 
404 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  44.27 
 
 
406 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  45.29 
 
 
409 aa  329  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  47.54 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  46.15 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  49.7 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  44.74 
 
 
421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  44.36 
 
 
404 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  46.02 
 
 
410 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  44.62 
 
 
407 aa  325  7e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  48.99 
 
 
425 aa  325  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  45.18 
 
 
406 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  43.67 
 
 
402 aa  323  3e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  51.01 
 
 
433 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  51.01 
 
 
414 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  48.7 
 
 
462 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  45.22 
 
 
408 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  44.16 
 
 
404 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  44.53 
 
 
424 aa  322  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  43.97 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  42.31 
 
 
408 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  47.09 
 
 
405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  41.79 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  44.64 
 
 
405 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  46.19 
 
 
462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  46.19 
 
 
462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  48.48 
 
 
431 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  45.03 
 
 
404 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  44.42 
 
 
423 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  48.12 
 
 
425 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  42.75 
 
 
401 aa  318  9e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  47.59 
 
 
403 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  47.83 
 
 
425 aa  316  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  42.24 
 
 
398 aa  316  4e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  45.66 
 
 
435 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  45.11 
 
 
409 aa  316  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  41.41 
 
 
406 aa  315  8e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  43.22 
 
 
404 aa  314  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  42.97 
 
 
573 aa  313  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  43.3 
 
 
407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  43.52 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  43.69 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  43.52 
 
 
407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  46.69 
 
 
434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  46.57 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  46.96 
 
 
425 aa  312  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  42.29 
 
 
608 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  41.94 
 
 
408 aa  309  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  41.84 
 
 
408 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  42.11 
 
 
648 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  46.44 
 
 
430 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  41.37 
 
 
416 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.26 
 
 
398 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.16 
 
 
402 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0120  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.66 
 
 
389 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.08 
 
 
384 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.77 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.04 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.22 
 
 
389 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.36 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.93 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.15 
 
 
391 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.51 
 
 
396 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.51 
 
 
396 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
398 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0107  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.99 
 
 
398 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.407437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
397 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.98 
 
 
397 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3900  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.25 
 
 
397 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.339123  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4104  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.25 
 
 
397 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130063  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3992  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.25 
 
 
397 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.061688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.25 
 
 
397 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.98 
 
 
397 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.98 
 
 
397 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.98 
 
 
397 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.07 
 
 
397 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 
392 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.63 
 
 
397 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.38 
 
 
397 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.81 
 
 
397 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.68 
 
 
397 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>