More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3210 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  77.9 
 
 		 439 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 435 aa  898    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  67.41 
 
 		 409 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  66.91 
 
 		 409 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  66.01 
 
 		 409 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  67.08 
 
 		 410 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  65.19 
 
 		 409 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  69.15 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  65.19 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  64.44 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  65.93 
 
 		 409 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  67.73 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  67.73 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  66.18 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  66.08 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  66.33 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  64.75 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  66.17 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  65.25 
 
 		 462 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  65.25 
 
 		 462 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  63.5 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  63.5 
 
 		 433 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  63.43 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  59 
 
 		 403 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  58 
 
 		 403 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  59.85 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  57 
 
 		 408 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  57.5 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  58 
 
 		 403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  57.75 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  55.75 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  54.95 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  57.5 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  55.78 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  59.5 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  57.75 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  57.75 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  55.03 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  57 
 
 		 404 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  57.25 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  58.5 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  59.35 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  55.7 
 
 		 408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  54.25 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  57.22 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  58.25 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  57.75 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  55.25 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  56.19 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  54.68 
 
 		 408 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  56.42 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  54.61 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  54.86 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  54.86 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  54.75 
 
 		 407 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  55.86 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  54.75 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  51.9 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  54.04 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  50.12 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  50.12 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  50 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  48.51 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  47.55 
 
 		 608 aa  408  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  53.27 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  46.56 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  50.9 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  51.69 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  44.91 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  45.66 
 
 		 400 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.96 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.31 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.67 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.13 
 
 		 399 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.56 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.66 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.54 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.46 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.28 
 
 		 401 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  35.45 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.53 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.71 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.93 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.84 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  33.6 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.66 
 
 		 404 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.2 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.36 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00066  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.27 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3021  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.96 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 		 399 aa  216  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.81 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.04 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.51 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.52 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.76 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.36 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.83 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>