More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1325 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  84.62 
 
 		 403 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  86.6 
 
 		 403 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 403 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  86.35 
 
 		 403 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  80.15 
 
 		 403 aa  683    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  76.43 
 
 		 403 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  69.65 
 
 		 404 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  71.32 
 
 		 404 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  73.7 
 
 		 405 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  72.7 
 
 		 405 aa  596  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  70.82 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  71.96 
 
 		 405 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  72.21 
 
 		 423 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  69.9 
 
 		 406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  69.58 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  67.41 
 
 		 404 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  62.81 
 
 		 406 aa  525  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  63.12 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  62.69 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  61.79 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  64.68 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  61.54 
 
 		 408 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  61.29 
 
 		 409 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  60.55 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  60.05 
 
 		 409 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  60.5 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  62.03 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  60.4 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  60.85 
 
 		 407 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  60.6 
 
 		 407 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  59.65 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  60.34 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  61.75 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  58.81 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  62.44 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  58.77 
 
 		 421 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  62.44 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  58.72 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  60.7 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  60.76 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  58.96 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  59.8 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  62.94 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  59.95 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  60.2 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  61.19 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  59.7 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  61.19 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  60.45 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  58.52 
 
 		 424 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  59.2 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  59 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  56.33 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  52.74 
 
 		 406 aa  448  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  53.21 
 
 		 648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  51.61 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  52.88 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  51.63 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  57.46 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  49.76 
 
 		 608 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  55.53 
 
 		 408 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  49.39 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.01 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  48 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.95 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  38.57 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.44 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.44 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.43 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.59 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.27 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.27 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.52 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.66 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.02 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.02 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.37 
 
 		 388 aa  235  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.77 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.02 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.34 
 
 		 395 aa  234  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1510  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0574329  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.75 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.97 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.84 
 
 		 397 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  33.75 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0006  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410368  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 451 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1151  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326917  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1431  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.32 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.57 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>