75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0793 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  42.15 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  41 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  40.59 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  40.59 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  42.98 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  40 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  37.16 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  35.74 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  37.04 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  39.32 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  33.72 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  36.86 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  32.64 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  34.55 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  31.87 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  28.94 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  31.56 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  29.89 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  26.94 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  29.36 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  30.14 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  29.78 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  29.79 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  29 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  29.1 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  29.1 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  29.1 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  29.53 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  29.68 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  29.1 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  29.1 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  26.74 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  28.57 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  28.57 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  28.51 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  27.97 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  30.23 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  30.57 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  28.03 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  32.74 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  28.64 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  27.48 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  29.02 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  27.45 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  27.48 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  27.97 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  27.43 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.01 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  25.89 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  26.09 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.6 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  26.5 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  25.19 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2352  MltA-interacting MipA  27.76 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  28.05 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  24.69 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  25.75 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  30.67 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  28.81 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  25.97 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  28.74 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  22.63 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  23.5 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1330  putative outer membrane protein  25.09 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.428976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  22.63 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  31.93 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  21.81 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0909  MltA-interacting MipA family protein  27.44 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  21.81 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  30.18 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  30.18 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  23.03 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  29.37 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>