76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2290 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  91.97 
 
 
378 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  91.64 
 
 
864 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  91.64 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  72.37 
 
 
300 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  72.37 
 
 
292 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  72.37 
 
 
300 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  69.5 
 
 
292 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  72.37 
 
 
293 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  71.6 
 
 
292 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  72.09 
 
 
292 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  67.31 
 
 
279 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  60.78 
 
 
298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  62.79 
 
 
298 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  56.99 
 
 
291 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  54.98 
 
 
299 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  45.9 
 
 
288 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  31.17 
 
 
285 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  29.61 
 
 
282 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  30.83 
 
 
272 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  30.51 
 
 
248 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  30.51 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  30.74 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  30.51 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  29 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  28.14 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  30.13 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  27.94 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  30.13 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  30.13 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  30.13 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  29.71 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  28.87 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  30.38 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  29.24 
 
 
248 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  28.81 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  29.24 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  28.62 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  27.97 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  26.41 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  27.47 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  30.77 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  29.15 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  29.29 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  29.02 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  27.97 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  30.54 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  27.85 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  28.99 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  28.38 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  25.71 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  29.32 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  30.08 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  25.9 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  28.03 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  27.73 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  28.8 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  22.78 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  24.79 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  26.02 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  27.23 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  27.47 
 
 
225 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  24.78 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  33.64 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  25.45 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  24.79 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  24.46 
 
 
289 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  27.78 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  24.79 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  23.32 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  22.54 
 
 
271 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  28.41 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  26.61 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  26.99 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  30.11 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>