35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1423 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  28.37 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  27.43 
 
 
279 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  28.23 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  28.23 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  27.94 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  27.13 
 
 
864 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  27.02 
 
 
292 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  27.13 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  27.13 
 
 
378 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  27.47 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  25.09 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  24.73 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  26.18 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  25.75 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  27.35 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  28.02 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  26.09 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.58 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  25.51 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  26.05 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  22.73 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  25.23 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  25.53 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  23.98 
 
 
266 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  25.68 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  25.62 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  22.31 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  25 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  27.17 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  22.84 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  26.48 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  25.5 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>