76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1214 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  89.6 
 
 		 298 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  67.28 
 
 		 279 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  66.8 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  66.54 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  66.54 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  66.54 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  64.2 
 
 		 292 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  62.65 
 
 		 292 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  64.2 
 
 		 292 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  62.26 
 
 		 864 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  62.65 
 
 		 378 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  62.65 
 
 		 378 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  62.65 
 
 		 298 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  59.14 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  56.16 
 
 		 299 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  51.31 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  30.99 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  31.15 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  28.76 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  29.89 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  28.16 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  28.16 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  30.52 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  27.9 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  27.76 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  29.59 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  29.66 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  28.31 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  28.33 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  28.1 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  28.33 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  28.33 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  28.33 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  28.33 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  28.33 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  25.09 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  29.25 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  24.57 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  26.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  26.36 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  26.45 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  29.83 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  26.12 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  28.02 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  27.2 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  25.97 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  29.11 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.19 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  27.57 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  27.9 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  27.75 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  27.97 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  25.93 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  25 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  25.53 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  24.24 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  22.04 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  24.58 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  23.28 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  25.7 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  32.73 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  23.03 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  22.08 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  26.94 
 
 		 265 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  25.22 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  24.89 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  24.4 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  23.08 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  26.05 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>