58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3115 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  100 
 
 		 288 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  46.4 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  32.75 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  34.29 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  32.79 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  34.01 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  30.6 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  28.73 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  31.87 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  31.1 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  27.43 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  31.43 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  25.89 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  29.84 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  28.06 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  29.59 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  30.42 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  29.34 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  31.43 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  31.43 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  29.34 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  27.34 
 
 		 265 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  30.45 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  31.08 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  29.17 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  29.55 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  29.55 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  29.29 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  29.67 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  27.71 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  29.55 
 
 		 864 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  29.71 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  28.34 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  25.82 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  27.03 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  27.18 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  25.42 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  28.98 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  25.62 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  27.63 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  25.73 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  23.18 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  24.91 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  24.1 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  25.31 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  30.25 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  28.51 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  28.69 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  30.77 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  27.89 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  27.84 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  23.48 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  23.5 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  25.5 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  25.75 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  23.01 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>