106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2702 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  77.34 
 
 
278 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  34.83 
 
 
261 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  37.61 
 
 
248 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  37.18 
 
 
288 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  32.59 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  37.18 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  33.88 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  33.88 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  33.76 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  33.88 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  34.47 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  33.88 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  33.88 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  33.88 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 
248 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  33.21 
 
 
271 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  32.48 
 
 
248 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  32.91 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  30.98 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 
259 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  30.94 
 
 
266 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  29.78 
 
 
223 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  30.52 
 
 
298 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  27.8 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  27.8 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  30.45 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  26.97 
 
 
864 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  27.31 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  28.87 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  28.11 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  30.6 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  27.31 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  26.94 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  26.94 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  27.8 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  25.33 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  25.71 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.48 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.82 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  26.59 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  28.99 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  26.85 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  29.52 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  28.34 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  28.62 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  26.34 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  22.86 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.42 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  24.48 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  24.15 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  35.79 
 
 
249 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  25.85 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  35.63 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  24.47 
 
 
285 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  26.52 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  25.37 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  27.38 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  25.19 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  35.63 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  25.79 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  32.97 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  26.28 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  26.09 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  24.91 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  26.14 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  26.14 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  26.14 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  26.28 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  26.14 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  26.14 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  25.84 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  25.38 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  25.47 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  26.4 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  21.67 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  23.92 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  24 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  24.45 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  31.96 
 
 
497 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  24.81 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  24.43 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  26.51 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  23.53 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  24.43 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  23.53 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  24.43 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  24.43 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  23.53 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>