61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3082 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  100 
 
 		 282 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  47.49 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  39.03 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  35.98 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  34.89 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  35.51 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  32.59 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  33.62 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  31.74 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  31.06 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  31.06 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  31.14 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  29.79 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  31.14 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  29.79 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  31.14 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  31.14 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  31.14 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  31.14 
 
 		 259 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  30.4 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  31.14 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  26.77 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  27.57 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  27.35 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  22.52 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  22.63 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  22.63 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  22.78 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  22.63 
 
 		 864 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  25.54 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  25.93 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  23.2 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  22 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  25.93 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  23.2 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.32 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  23.53 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  23.55 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  23.34 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  23.6 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  26.14 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  23.91 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  22.49 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  24 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  28.07 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  26.55 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  23.33 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  25.52 
 
 		 266 aa  49.3  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  23.47 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  25.97 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  30.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  27.09 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  26.24 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  23.01 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  25.51 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>