67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1237 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  98.79 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  89.52 
 
 		 248 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  89.11 
 
 		 248 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  89.11 
 
 		 288 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  88.71 
 
 		 248 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  66.13 
 
 		 259 aa  340  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  66.13 
 
 		 248 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  66.13 
 
 		 248 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  66.13 
 
 		 248 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  65.32 
 
 		 259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  65.73 
 
 		 248 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  67.74 
 
 		 304 aa  334  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  46.69 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  32.67 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  33.06 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  32.1 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  30.08 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  31.74 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  30.8 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  32 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  31.35 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  28.31 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  30.08 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  30.21 
 
 		 288 aa  85.5  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  29.24 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  27.97 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  27.97 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  27.12 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  28.99 
 
 		 864 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  27.27 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  26.45 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  26.69 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  27.35 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  25.32 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  28.63 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  25.55 
 
 		 298 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  28.27 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  27 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  29.58 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.51 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  27.76 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  31.47 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  26.07 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  23.61 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  25.38 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  25.1 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  24.81 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  25.21 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  27.34 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  23.17 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  24.38 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  27.54 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  31.03 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  28.05 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  26.1 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  26.47 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  24.9 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  26.47 
 
 		 270 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  26.96 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  22.63 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  35 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  24.14 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  35.29 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  23.43 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>