66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0935 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  100 
 
 
248 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  99.19 
 
 
259 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  98.79 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  98.79 
 
 
259 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  98.79 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  98.79 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  86.69 
 
 
304 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  66.53 
 
 
248 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  66.53 
 
 
288 aa  330  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  66.13 
 
 
248 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  65.73 
 
 
248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  64.92 
 
 
248 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  65.32 
 
 
248 aa  324  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  46.55 
 
 
261 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  34.29 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  33.88 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  31.14 
 
 
282 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  30.43 
 
 
259 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  31.22 
 
 
271 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  32.78 
 
 
266 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  30.13 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  30.94 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  30.38 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  30.47 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  28.09 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  28.09 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  28.09 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  30.29 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  30.29 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  30.59 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  28.33 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  31.4 
 
 
864 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  26.81 
 
 
292 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  27.23 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  26.81 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  26.61 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  26.38 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  28.75 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  30.17 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  27.08 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  30 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  31.21 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 
272 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  30.57 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  27 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  26.2 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  26.46 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  24.24 
 
 
299 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  28.57 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  29.3 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  25.41 
 
 
274 aa  58.9  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  27.42 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  26.07 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  27.71 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  24.84 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  31.62 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  27.49 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  35.14 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  22.73 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  27.35 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2133  hypothetical protein  36 
 
 
90 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.483359  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  23.6 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  23.6 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  29.49 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  27.16 
 
 
292 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>