112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0936 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  100 
 
 
257 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  57.36 
 
 
258 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  49.22 
 
 
257 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  49.22 
 
 
257 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  49.22 
 
 
257 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  48.84 
 
 
257 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  48.84 
 
 
257 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  46.9 
 
 
257 aa  236  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  45.74 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  46.12 
 
 
257 aa  231  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  44.36 
 
 
270 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  27.13 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  25.97 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  32.1 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  25.29 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  31.45 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  32.84 
 
 
491 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  29.33 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  24.62 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  30.2 
 
 
497 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  22.67 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  22.67 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  22.67 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  28.25 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  28.03 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  28.03 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  24.03 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  28.07 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  25.54 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  23.64 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  22.39 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  29.3 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  28.24 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.13 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  23.44 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  23.44 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  23.44 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  23.44 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  23.44 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  28.12 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  27.78 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  28.29 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  24.26 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  27.68 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.67 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.67 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  24.16 
 
 
292 aa  58.9  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.67 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  26.99 
 
 
252 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.67 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  30.34 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.67 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  23.08 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  27.06 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  26.63 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  23.08 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  22.22 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  31.78 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  26 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  27.03 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  23.65 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  23.12 
 
 
287 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  22.16 
 
 
304 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  24.84 
 
 
259 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  23.12 
 
 
287 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  22.62 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  24.84 
 
 
248 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  24.84 
 
 
248 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  24.84 
 
 
248 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  25.82 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  24.22 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  25.17 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  24.84 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  22.41 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  24.36 
 
 
288 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  22.97 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  24.23 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  25.85 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  31.91 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  31.4 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  29.14 
 
 
250 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  26.74 
 
 
281 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  25.84 
 
 
289 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  26.8 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  25.58 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  26.74 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  26.74 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  28.74 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  28.09 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  24.8 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  22.03 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  31.9 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>