79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3501 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  34.29 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  36.43 
 
 
278 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 
278 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  32.91 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  30.45 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  29.48 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  29.48 
 
 
248 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  29.48 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  29.91 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  30.22 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  30.59 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  30.59 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  30.51 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  30.59 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  30.42 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  30.59 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  28.17 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  29.25 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  29.02 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  28.45 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  29.08 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  26.77 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  28.06 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  25.32 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  28.77 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  29.08 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  29.08 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  28.11 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  28.85 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  24.89 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  27.94 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  27.94 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  25.9 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  27.94 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  30.22 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  27.2 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.76 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  25.5 
 
 
378 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  27.23 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  26.83 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  25.5 
 
 
378 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  27.17 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  27.31 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  25.5 
 
 
864 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  26.39 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  28.04 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  26.82 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.12 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  40.7 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  38 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  26.24 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  28.57 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  36 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  28.69 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  26.29 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  25.88 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  38.89 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41290  hypothetical protein  65.79 
 
 
38 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.315755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  25.75 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  30.28 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  29.36 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  29.36 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  29.36 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  29.36 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  29.36 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  28.36 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  25.46 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  28.44 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  28.44 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  25.45 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  32 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  33 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  25.26 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  27.64 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  25.69 
 
 
223 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>