64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0542 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  92.59 
 
 		 270 aa  510  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  56.75 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  55.86 
 
 		 268 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  57.25 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  40.59 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  36.51 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  35.32 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  34.47 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  31.22 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  34.32 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  32.79 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  31.33 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  31.4 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  29.3 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.57 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.29 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  29.2 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  36.26 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  28.33 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  28.8 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  28.8 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  27.43 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  28 
 
 		 864 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  25.76 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  26.52 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  27.76 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  26.2 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  24.69 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  25.18 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  28.05 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  28.09 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  25.75 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  24.58 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  31.06 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  31.06 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  31.82 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  27.66 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  30.94 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  30.94 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  34.02 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  21.9 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  30.94 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  30.94 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  25.32 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  26.67 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  26.39 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  26.88 
 
 		 261 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  27.64 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  33 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  31 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  28.8 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  28.85 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  28.46 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  27.73 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  27.73 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  27.73 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  27.73 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>