95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3134 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  62.16 
 
 
261 aa  330  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  39.62 
 
 
271 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  35.98 
 
 
282 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  32.08 
 
 
278 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  33.03 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  30.98 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  32.61 
 
 
288 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  32.61 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  32.61 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  31.74 
 
 
248 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  31.3 
 
 
248 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  31.36 
 
 
261 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  30.43 
 
 
259 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  30.43 
 
 
248 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  30.43 
 
 
259 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  30.43 
 
 
248 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  30.43 
 
 
248 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  30.43 
 
 
248 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  30.87 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  28.7 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  30.42 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  28.76 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  30.74 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  25.91 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  25.74 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  26.83 
 
 
378 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  26.03 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  24.68 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  24.68 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  26.83 
 
 
864 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  23.02 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  26.42 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  26.02 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  26.21 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  24.28 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  24.28 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  24.28 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  27.08 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  24.22 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  27.63 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  24.26 
 
 
282 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  22.98 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  41.25 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  41.25 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  41.25 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  41.25 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  41.25 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  27.35 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  40 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  24.28 
 
 
285 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  38.75 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  23.83 
 
 
292 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  40 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  37.21 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  24.58 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  34.09 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  40 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  24.14 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  22.46 
 
 
298 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  28.24 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  24.62 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  26.05 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  22.08 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  27 
 
 
491 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  24.62 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.98 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  24.1 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.98 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  24.1 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  24.1 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  24.1 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  36.56 
 
 
270 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  23.5 
 
 
277 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  31.34 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  30.69 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  25.59 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1330  putative outer membrane protein  23.66 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.428976  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  26.48 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  22.61 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  25.33 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  30.95 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  30.43 
 
 
257 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  29.76 
 
 
273 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>