80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3799 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 292 aa  590  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  99.32 
 
 		 292 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  89.38 
 
 		 292 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  90.72 
 
 		 300 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  90.07 
 
 		 292 aa  507  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  90.72 
 
 		 300 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  90.38 
 
 		 293 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  73.93 
 
 		 864 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  74.32 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  73.93 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  72.37 
 
 		 298 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  65 
 
 		 279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  64.48 
 
 		 298 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  63.85 
 
 		 298 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  60.31 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  53.14 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  45.2 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  32.47 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  30.47 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  29.17 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  29.88 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  30.3 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  29.71 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  29.44 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  28.81 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  29.11 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  28.81 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  28.81 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  31.15 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  29.34 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  27.8 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  28.52 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  29.24 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  26.69 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  28.93 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  26.81 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  26.81 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  26.69 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  26.81 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  26.81 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  26.81 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  26.69 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  25.82 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  26.81 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  28.26 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  29.55 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  23.91 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  29.18 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  29.08 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  30.45 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  27.68 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  27.85 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  27.6 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  23.53 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  26.12 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  24.68 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  26.75 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  25.66 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  27.06 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  26.81 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  24.51 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  26.67 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  24.38 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  26.81 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  24.65 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  31.06 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  22.62 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  25.16 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  24.77 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  25.86 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  24.67 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  23.53 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  24.31 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  29.41 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  29.41 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  29.41 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  24.36 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  26.14 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.55 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>