52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1574 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  49.22 
 
 
273 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  38.02 
 
 
289 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  37.31 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  40.51 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  34.98 
 
 
282 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  33.47 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  33.72 
 
 
277 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  33.62 
 
 
270 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  34.47 
 
 
270 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  31.91 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  30.64 
 
 
268 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  33.19 
 
 
270 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  28.91 
 
 
272 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  27.34 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  29.11 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  28.52 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  24.78 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  27.88 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  33.02 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  26.24 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  25.71 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  24.37 
 
 
378 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  23.79 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  28.73 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  24.37 
 
 
378 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  24.55 
 
 
253 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  23.95 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  22.48 
 
 
285 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  25.21 
 
 
864 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  26.94 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  24.7 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  23.5 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  23.5 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  26.36 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  26.36 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  23.5 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  26.36 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  24.77 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  21.67 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  24.11 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  22.46 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  30.33 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  24.77 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  25.56 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  23.72 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  24.48 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  24.48 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  24.48 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  24.48 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  26 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  24.14 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>