44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0358 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  49.22 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  39.68 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  38.24 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  35.5 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  37.16 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  34.32 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  34.56 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  32.18 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  29.52 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  31.1 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  30.8 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  30.52 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  31.98 
 
 		 263 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  23.66 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  24.38 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  33.88 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  33.64 
 
 		 378 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  24.44 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  33.64 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  25.11 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  25.99 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  25.99 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  33.64 
 
 		 378 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  31.65 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  25.55 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  33.64 
 
 		 864 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  25.55 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  36.59 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  32.73 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  24.62 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  25.65 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  24.67 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  24.67 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  23.88 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  24.29 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  31 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  25.45 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  23.15 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>