60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3867 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  33.9 
 
 
278 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  33.91 
 
 
270 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  29 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  27.47 
 
 
256 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  30.39 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  27.75 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  24 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  29.06 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  24.78 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  35.44 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  27.9 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  24.06 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  26.2 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.14 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  26.2 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2352  MltA-interacting MipA  25.1 
 
 
336 aa  58.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  26.96 
 
 
261 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  27.57 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 
282 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  24.67 
 
 
286 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  24.44 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  21.24 
 
 
276 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0909  MltA-interacting MipA family protein  27.2 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  26.37 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  31.25 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  29.65 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  26.82 
 
 
258 aa  52  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  26.8 
 
 
261 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  24.37 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  29.22 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  28.7 
 
 
273 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  30.16 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  29.63 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  25.65 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  23.11 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  29.21 
 
 
248 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  25.77 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  25.77 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 
279 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  26.64 
 
 
292 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  31.9 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  25.81 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  29.37 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  23.5 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  24.56 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  23.15 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  30.3 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  24.68 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  24.68 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  24.68 
 
 
293 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  29.63 
 
 
289 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  27.75 
 
 
257 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  24.54 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  24.89 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  26.44 
 
 
278 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  25.51 
 
 
318 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  28.99 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>