78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1748 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  32.74 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  26.72 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.97 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  31.85 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  27.6 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  30.63 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  28.11 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  29.17 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  27.72 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  24.89 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  32.92 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  25.99 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  26.49 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  25.2 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  24.45 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  34.09 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  40.7 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  30.81 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  26.26 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  26.07 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  29.76 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.74 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4756  putative outer membrane protein  26.11 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  26.07 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.7 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  25.46 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  22.86 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  27.06 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  27.62 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  22.86 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  30.34 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  23.89 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  26.59 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  23.33 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  27.06 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  28.33 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  25.79 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  26.19 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  27.22 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  27.62 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  24.29 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  26.64 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  24.43 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  24.53 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  28.08 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  28.08 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  26.05 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  28.43 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  25.99 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  26.76 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  23.86 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  25.6 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  22.76 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  32.28 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  22.76 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.77 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  25.51 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  27.27 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  27.27 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  27.27 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  27.27 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  27.27 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  23.86 
 
 		 864 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  24.43 
 
 		 292 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  23.17 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  22.67 
 
 		 246 aa  42  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  22.76 
 
 		 246 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  22.76 
 
 		 246 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>