76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5393 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
298 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  89.6 
 
 
298 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  69.2 
 
 
279 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  66.02 
 
 
292 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  64.59 
 
 
300 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  64.59 
 
 
300 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  64.59 
 
 
293 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  63.42 
 
 
292 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  63.42 
 
 
292 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  63.04 
 
 
864 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  63.42 
 
 
378 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  63.42 
 
 
378 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  61.48 
 
 
292 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  63.42 
 
 
298 aa  348  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  59.53 
 
 
291 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  57.31 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  51.54 
 
 
288 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  32.23 
 
 
272 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  29 
 
 
282 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  29.44 
 
 
285 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  29.18 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  28.33 
 
 
273 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  29.69 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  29.39 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  29.84 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  26.07 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  27.04 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  29.32 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  27.04 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  26.84 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  29.68 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  28.03 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  30.25 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  28.11 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  24.73 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  28.33 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  26.61 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  26.61 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  26.61 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  26.61 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  26.61 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  26.61 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.27 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  25.62 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  28.06 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.39 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  27.6 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  25.75 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  27.16 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  25.11 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  25.52 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  26.16 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  28.81 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  28.88 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  29.11 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  28.25 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  26.34 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  25.93 
 
 
282 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  24.78 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  25.42 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  27.04 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  26.58 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  25.18 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  23.36 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  22.84 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  25.31 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  31.65 
 
 
273 aa  52.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  22.46 
 
 
259 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  22.42 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  23.89 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  30.33 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  24.5 
 
 
268 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  24.56 
 
 
278 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  22.13 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  26.07 
 
 
242 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  22.77 
 
 
258 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>