34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4161 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 270 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  33.91 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  29.93 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  28.68 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  29.03 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  28.11 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  28.52 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.04 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  26.47 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  26.03 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  26.27 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  29.89 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2352  MltA-interacting MipA  26.21 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  26.01 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  28.18 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  27.44 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  27.89 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.45 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  24.59 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  31.15 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  33.04 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  22.78 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  26.48 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  28.35 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  22.22 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.47 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  26.36 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  30.59 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  29.48 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>