88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3319 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  33.9 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  29.39 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  26.94 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  27.24 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  36.26 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  36.26 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2352  MltA-interacting MipA  29.02 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  32.96 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  34.42 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  32.4 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  26.67 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  33.1 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  34.48 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  21.79 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  24.79 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.88 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  42.67 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  39.18 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.33 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  31.85 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  40 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  26.18 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  29.74 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  35.42 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  25.79 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  28.73 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  30.05 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  23.26 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  36.78 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  27.7 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  27.78 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  24.91 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  38.75 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  38.75 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  30.77 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  38.75 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  25.16 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  32.89 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  31.52 
 
 		 864 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  25.16 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  26.51 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  25.89 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  38.89 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  25.79 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  25.79 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  25.79 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  33.8 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  28.19 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  32.5 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  27.03 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  26.81 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  25.16 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  37.66 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  34.95 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  33.75 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  33.75 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  33.75 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  33.75 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  33.75 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  35.14 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  35.14 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  35.14 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  35.14 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  24.56 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  35.14 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  35.14 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  33.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  27.12 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  25.78 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  35.06 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  30.14 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  24.4 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  33.75 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  26 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  35.29 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  35.21 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  35.21 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  35.21 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  23.86 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  35.29 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>