92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1081 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  32.79 
 
 
279 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  30.61 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  31.15 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  32.39 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  31.17 
 
 
864 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  30.74 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  32.65 
 
 
293 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  32.65 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  32.65 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  34.98 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  31.17 
 
 
378 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  31.17 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  29.39 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  31.15 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  31.15 
 
 
292 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  31.02 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  28.28 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  29.92 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  24.34 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  28.57 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  26.64 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.13 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  28.52 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  25.73 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  25.33 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  27.71 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  23.46 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  25.48 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  25 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  23.48 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  27.39 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  27.91 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  27.39 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  27.39 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  27.39 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  25.69 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  22.63 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  26.2 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  26.2 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  24.56 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  26.07 
 
 
248 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  23.96 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  26.07 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  25.1 
 
 
258 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  25 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  23.34 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  24.07 
 
 
271 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  24.22 
 
 
259 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  23.79 
 
 
272 aa  58.9  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  24.08 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  24.91 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  23.63 
 
 
284 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  25.75 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  30.93 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  25.83 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  28.46 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  25.41 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  25.83 
 
 
249 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.1 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  29.27 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  22.73 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  24.25 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  24.54 
 
 
286 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  23.5 
 
 
223 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  26.35 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  30.1 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  30.14 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  23.31 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  27.52 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  27.52 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  27.52 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  22.22 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  24.02 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  21.58 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  26.76 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  25.75 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  28.99 
 
 
235 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1157  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 
167 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0481888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>