47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1031 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
273 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  40.16 
 
 
265 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  38.62 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  38.24 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  38.24 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  36.18 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  36.51 
 
 
277 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  34.26 
 
 
282 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  32.77 
 
 
268 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  31.33 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  29.67 
 
 
270 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  32.19 
 
 
270 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  29.13 
 
 
286 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  28.21 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  30.45 
 
 
378 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  28.57 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  30 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  30.97 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  30.45 
 
 
864 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  30.97 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  30.97 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  30 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  30.91 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  30.45 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  30.45 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  29.2 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  29.95 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  29.28 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  27.75 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  29.82 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  28.25 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  29.41 
 
 
291 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  27.48 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  26.64 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  28.11 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  27.67 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  26.61 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  29.21 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  24.38 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  28 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  34.09 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  35.79 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  29.77 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  35.14 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  26.09 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>