107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1656 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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Replicon accession

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% identity

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Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  100 
 
 
270 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  92.96 
 
 
270 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  52.91 
 
 
263 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  36 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  33.92 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  33.92 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  33.92 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  33.92 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  33.92 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  34.91 
 
 
256 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  34.91 
 
 
273 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  34.91 
 
 
256 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  32.66 
 
 
250 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  35.15 
 
 
246 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  33.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  32.6 
 
 
248 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  33.06 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  31.98 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  32.39 
 
 
246 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  31.98 
 
 
246 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  31.98 
 
 
246 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  31.98 
 
 
246 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  31.98 
 
 
246 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  31.98 
 
 
246 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  34.5 
 
 
254 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  31.98 
 
 
246 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  31.84 
 
 
249 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  30.71 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  32.21 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  29.33 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  27.59 
 
 
491 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  27.45 
 
 
497 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  32.02 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  26.24 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  27.46 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  28.5 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  27.56 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  28.04 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  27.11 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  27.59 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  28.19 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2040  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  26.22 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  28.25 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  24.23 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  24.27 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  26.81 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  24.79 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1157  MltA-interacting MipA family protein  29.25 
 
 
167 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0481888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  27.08 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  27.06 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  24.77 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  29.27 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  26.79 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  28.89 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  25.73 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  25.64 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  30.28 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  32.58 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
327 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  28.4 
 
 
278 aa  52  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  26.28 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  28.07 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  24.02 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  26.28 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  27.49 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  22.49 
 
 
211 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1626  MltA-interacting protein MipA  20.98 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.124985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  23.21 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.97 
 
 
282 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  25.67 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  23.85 
 
 
252 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  23.33 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  24.02 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  29.76 
 
 
299 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  25.61 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  23.42 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.11 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  29.59 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  23.42 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  23.42 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  26.47 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  25.61 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  29.37 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  25.61 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2535  hypothetical protein  20.09 
 
 
429 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  25 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  26.47 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  25.35 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  26.47 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
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