42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04838 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  47.49 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  42.99 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  33.79 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  33.03 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  30.94 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  30.14 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  30.49 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  30.49 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  30.49 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  30.49 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  30.49 
 
 		 259 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  27.85 
 
 		 288 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  27.85 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  29.78 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  27.85 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  28.31 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  28.31 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  29.46 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  26.7 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  28.51 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  21.93 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  25.23 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  26.15 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  24.77 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  26.39 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 279 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  25.22 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  23.89 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  23.19 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  27 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  23.5 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  24.31 
 
 		 292 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  24.31 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  26.61 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  23.85 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  25.69 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  26.34 
 
 		 378 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  26.34 
 
 		 378 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  23.85 
 
 		 256 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>