112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0982 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 316 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  96.81 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  96.81 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  92.09 
 
 		 316 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  71.34 
 
 		 340 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  71.95 
 
 		 328 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  72.61 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  65.91 
 
 		 335 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  68.39 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  62.38 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  61.09 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 311 aa  358  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  55.41 
 
 		 311 aa  358  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  58.33 
 
 		 336 aa  355  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  55.95 
 
 		 314 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  52.6 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  55.18 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  52.94 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  54.02 
 
 		 336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  54.02 
 
 		 336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  54.02 
 
 		 321 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  51.48 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  54 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  54 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  54 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  54.03 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  53.67 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  50.79 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  52.63 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  53.99 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  52.3 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  52.3 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  51.52 
 
 		 310 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  51.97 
 
 		 335 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  51.97 
 
 		 308 aa  321  8e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  51.97 
 
 		 308 aa  321  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  51.97 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  49.4 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  51.97 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  51.97 
 
 		 308 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  51.64 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  51.41 
 
 		 360 aa  315  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  47.81 
 
 		 382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 		 364 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  49.35 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  49.53 
 
 		 364 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  47.6 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  49.02 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  48.92 
 
 		 398 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  49.68 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  48 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  47.92 
 
 		 362 aa  297  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  48.4 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  50.65 
 
 		 357 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  48.4 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  48.4 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  48.88 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 404 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  49.17 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  43.65 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  46.53 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  45.87 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  52.87 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  31.44 
 
 		 245 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  42.26 
 
 		 165 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  30.51 
 
 		 434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  21.28 
 
 		 495 aa  79.7  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  50.77 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  27.38 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  27.16 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  26.38 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  27.27 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  27.27 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  27.27 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.33 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  27.27 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  27.27 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  35 
 
 		 496 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.96 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.68 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  31.07 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  25.76 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  32.95 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.35 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  25.76 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  25.76 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  25.76 
 
 		 396 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.07 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.73 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  30.93 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0713  hypothetical protein  25.67 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00301972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.53 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.08 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.66 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>