80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003679 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  100 
 
 		 375 aa  780    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  79.12 
 
 		 388 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  47.59 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  54.34 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  52.04 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  45.24 
 
 		 398 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  51.1 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  46.48 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  52.35 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  51.24 
 
 		 308 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  51.24 
 
 		 308 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  51.24 
 
 		 308 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  51.24 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  49.06 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  50.79 
 
 		 317 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  49.06 
 
 		 311 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  51.27 
 
 		 336 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  50.93 
 
 		 308 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  52.22 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  50.47 
 
 		 317 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  46.61 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  47.4 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  48.45 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  48.9 
 
 		 316 aa  328  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  49.23 
 
 		 322 aa  328  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  48.76 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  48.08 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  48.76 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  48.76 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  45.48 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  48.38 
 
 		 328 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  49.53 
 
 		 308 aa  325  7e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  48.12 
 
 		 311 aa  325  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  48.1 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  44.35 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  44.14 
 
 		 365 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  49.53 
 
 		 335 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  49.53 
 
 		 335 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  44.63 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  49.22 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  44.11 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  49.22 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  49.22 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  49.22 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  50.78 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  49.22 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  44.26 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  47.3 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  47.77 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  48.1 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  49.22 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  50.79 
 
 		 316 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  43.66 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  50.78 
 
 		 362 aa  315  7e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  47.49 
 
 		 341 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  48.21 
 
 		 330 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  46.56 
 
 		 336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  45.03 
 
 		 319 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  48.21 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  56.06 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  47.73 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  46.15 
 
 		 320 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  43.69 
 
 		 319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  42.68 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  43.26 
 
 		 165 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  28.68 
 
 		 245 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  27.69 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  66.67 
 
 		 73 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  23.1 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  25.37 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.43 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  25.62 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.45 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3323  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  26.47 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  27.21 
 
 		 284 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.68 
 
 		 348 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>