82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0985 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 340 aa  706    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  72.22 
 
 		 328 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  73.46 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  70.85 
 
 		 317 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  70.22 
 
 		 317 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  71.66 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  71.34 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  65.92 
 
 		 333 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  65.47 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  58.41 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  58.08 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  58.44 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  54.46 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  52.63 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  52.63 
 
 		 336 aa  360  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  53.14 
 
 		 321 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  54.98 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  52.27 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  54.66 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  51.95 
 
 		 316 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  52.29 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  52.65 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  53.44 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  54.15 
 
 		 308 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  54.15 
 
 		 308 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  54.15 
 
 		 308 aa  341  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  53.97 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  50.62 
 
 		 322 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  47.06 
 
 		 388 aa  335  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  53.31 
 
 		 305 aa  332  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  53.7 
 
 		 340 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  48.08 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  51.45 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  51.45 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  51.45 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  51.45 
 
 		 308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  51.45 
 
 		 308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  51.13 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  51.13 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  50.34 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  47.23 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  50.16 
 
 		 308 aa  322  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  50.8 
 
 		 308 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  47.14 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  46.45 
 
 		 365 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  45.88 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  45.88 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  44.21 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  45.43 
 
 		 327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  44.48 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  45.29 
 
 		 364 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  47.16 
 
 		 398 aa  305  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  44.77 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  45.27 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  47.21 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  45.81 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  45.13 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  47.42 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  47.13 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  47.81 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  40.6 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  46.53 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  42.41 
 
 		 319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  42.81 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  45.54 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  46.21 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  33.22 
 
 		 482 aa  136  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  30.68 
 
 		 245 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  42.6 
 
 		 165 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  28.81 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  22.88 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  48.53 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  25.7 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  24.66 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  25.28 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  25.14 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  27.54 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  29 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  30.97 
 
 		 536 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  29 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  29 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0713  hypothetical protein  24.3 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00301972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>