76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0127 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  92.84 
 
 		 364 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  94.49 
 
 		 364 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 364 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  83.93 
 
 		 308 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  69.97 
 
 		 375 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  69.42 
 
 		 365 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  70.08 
 
 		 365 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  70.36 
 
 		 365 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  68.68 
 
 		 357 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  59.95 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  55.15 
 
 		 404 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  57.51 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  52.41 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  61.49 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  56.43 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  53.75 
 
 		 320 aa  346  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  49.39 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  51.96 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  48.11 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  48.77 
 
 		 327 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  52.43 
 
 		 319 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  44.63 
 
 		 375 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  51.61 
 
 		 335 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  47.7 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  49.11 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  50.33 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  49.85 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  49.38 
 
 		 322 aa  316  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  48.42 
 
 		 336 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  47.42 
 
 		 336 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  47.42 
 
 		 336 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  47.42 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  47.21 
 
 		 345 aa  309  5e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  49.54 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  49.21 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  48.11 
 
 		 335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  50.99 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  45.29 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  49.19 
 
 		 308 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  48.11 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  48.11 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  49.19 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  49.19 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  49.19 
 
 		 308 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  49.52 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  51.3 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  46.25 
 
 		 327 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  48.86 
 
 		 308 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  49.19 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  47.27 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  49.52 
 
 		 317 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  48.92 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  49.53 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  47.87 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  48.5 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  48.5 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  48.5 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  48.5 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  48.5 
 
 		 308 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  47.52 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  44.24 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  48.17 
 
 		 301 aa  282  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  43.95 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  46.89 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 482 aa  143  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  43.27 
 
 		 165 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  28.52 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  26.67 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  22.11 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  47.06 
 
 		 73 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  28.9 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  28.41 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  23.64 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  25.62 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>