85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1273 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 339 aa  696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  91.96 
 
 		 336 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  71.2 
 
 		 335 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  67.86 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  58.41 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  63.34 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  62.15 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  62.7 
 
 		 317 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  62.06 
 
 		 316 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  61.82 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  62.38 
 
 		 316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  53.8 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  50.33 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  53.25 
 
 		 314 aa  354  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  50.47 
 
 		 327 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  55.91 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  50.46 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  51.99 
 
 		 336 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  51.59 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  51.59 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  51.59 
 
 		 321 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  53.05 
 
 		 311 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  53.72 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  55.78 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  55.78 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  50.9 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  48.43 
 
 		 380 aa  341  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  55.12 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  55.12 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  54.46 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  55.12 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  55.12 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  55.12 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  51.3 
 
 		 322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  55.12 
 
 		 308 aa  338  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  54.15 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  50.15 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  48.68 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  50.15 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  50.32 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  55.12 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  55.15 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  55.15 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  55.15 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  48.09 
 
 		 364 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  50.15 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  47.7 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  54.82 
 
 		 308 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  49.54 
 
 		 375 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  50.84 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  53.18 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  51.12 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  48.96 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  51.64 
 
 		 398 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  45.88 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  50.61 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  46.03 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  51.64 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  45.88 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  48.83 
 
 		 301 aa  301  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  47.9 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  43.77 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  46.28 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  52.46 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  32.95 
 
 		 245 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 		 482 aa  136  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  41.42 
 
 		 165 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  30.56 
 
 		 434 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  49.33 
 
 		 73 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  23.93 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.17 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.52 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  34 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.52 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.52 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  22.29 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.8 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  28 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  28.24 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.53 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.94 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.408193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.57 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>