75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3741 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 398 aa  816    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  60.34 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  59.59 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  58.4 
 
 		 380 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  60.27 
 
 		 364 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  59.95 
 
 		 364 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  58.7 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  56.07 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  56.59 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  56.74 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  56.59 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  58.43 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  57.3 
 
 		 357 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  60.67 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  61.08 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  52.92 
 
 		 320 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  53.48 
 
 		 332 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  50.16 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  45.24 
 
 		 375 aa  349  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  51.64 
 
 		 311 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  49.1 
 
 		 316 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  42.93 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  54.06 
 
 		 319 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  51.7 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  52.65 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  50.3 
 
 		 336 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  49.54 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  52.65 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  53.89 
 
 		 336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  52.08 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  50.89 
 
 		 333 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  48.52 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  51.64 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  48.91 
 
 		 322 aa  323  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 		 308 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  51.59 
 
 		 301 aa  322  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  49.52 
 
 		 310 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  51.26 
 
 		 308 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 		 308 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 		 308 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 		 308 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  49.23 
 
 		 362 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  49.85 
 
 		 316 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 308 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  50.31 
 
 		 308 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  50.31 
 
 		 308 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 308 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  45.58 
 
 		 340 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  48.82 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  48.92 
 
 		 317 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  48.62 
 
 		 317 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  45.67 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  47.45 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 		 316 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  48.41 
 
 		 305 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  44.78 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  52.84 
 
 		 311 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  44.86 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  31.49 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  41.38 
 
 		 165 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  28.93 
 
 		 245 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  28.41 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  23.55 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  45.59 
 
 		 73 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  29.38 
 
 		 264 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  29.38 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  27.27 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>