75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0122 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  94.49 
 
 		 364 aa  713    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 364 aa  754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  96.7 
 
 		 364 aa  730    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  82.74 
 
 		 308 aa  544  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  71.19 
 
 		 365 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  71.07 
 
 		 375 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  70.77 
 
 		 365 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  69.61 
 
 		 365 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  68.41 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  58.7 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  56.38 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  58.36 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  62.14 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  52.86 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  52.73 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  54.07 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  50.93 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  51.28 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  51.89 
 
 		 311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  45.36 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  52.26 
 
 		 335 aa  328  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  48.68 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  50.77 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  49.69 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  45.48 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  48.97 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  52.79 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  49.37 
 
 		 336 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  46.75 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  46.75 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  47.62 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  50.15 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  48.89 
 
 		 322 aa  316  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 314 aa  311  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  49.84 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  45.88 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  48.59 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  49.52 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  49.52 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  49.52 
 
 		 308 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  49.52 
 
 		 308 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  48.59 
 
 		 335 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  48.59 
 
 		 335 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  49.84 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  46.63 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  49.21 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  50.5 
 
 		 310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  49.52 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  49.54 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  51.13 
 
 		 333 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  49.84 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  45.65 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  45.69 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  48.52 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  47.06 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  48.37 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  48.54 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  48.54 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  48.54 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  48.54 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  44.55 
 
 		 319 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  47.84 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  44.66 
 
 		 340 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  46.92 
 
 		 311 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  42.69 
 
 		 165 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  28.52 
 
 		 245 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  26 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  22.54 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  47.06 
 
 		 73 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  28.9 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  28.9 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  28.32 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>