70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67775 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  100 
 
 
495 aa  1022    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 
482 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  24.81 
 
 
327 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  22.67 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  29.15 
 
 
434 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  22.18 
 
 
310 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  24.26 
 
 
319 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  22.9 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  24.91 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  24.91 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  24.91 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  24.91 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  24.66 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  22.26 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  23.62 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  21.78 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  22.92 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  22.88 
 
 
340 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  24.47 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  23.49 
 
 
308 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  24.6 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  21.89 
 
 
365 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  20.96 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  21.67 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  23.13 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  23.13 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  22.75 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  23.1 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  22.79 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  23.19 
 
 
245 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  22.54 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  22.58 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  21.77 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  22.11 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  23.13 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  23.13 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  23.13 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  23.13 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  23.13 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  23.13 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  21.78 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  21.45 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  23.51 
 
 
362 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  21.54 
 
 
336 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  25.7 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  25.7 
 
 
321 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  25.7 
 
 
336 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  22.81 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  23.44 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  22.29 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  23.85 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  23.77 
 
 
388 aa  77  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  20.85 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  23.19 
 
 
340 aa  77  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  20.93 
 
 
308 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  22.62 
 
 
341 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  21.54 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  22.76 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  23.85 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  19.24 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  19.65 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  19.81 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  22.99 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  18.69 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  22.68 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  22.57 
 
 
322 aa  63.9  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  23.43 
 
 
336 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  23.93 
 
 
339 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  21.89 
 
 
311 aa  57.4  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>