79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0957 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  98.7 
 
 
308 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  99.03 
 
 
308 aa  638    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  99.03 
 
 
335 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  99.03 
 
 
335 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  99.03 
 
 
335 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
308 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  98.7 
 
 
308 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  99.03 
 
 
308 aa  638    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  97.4 
 
 
308 aa  628  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  84.09 
 
 
308 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  84.09 
 
 
308 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  84.09 
 
 
308 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  83.77 
 
 
308 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  83.77 
 
 
308 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  77.56 
 
 
305 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  64.82 
 
 
311 aa  417  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  63.52 
 
 
311 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  57.65 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  57.33 
 
 
336 aa  354  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  57.33 
 
 
321 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  56.37 
 
 
335 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  53.62 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  51.46 
 
 
314 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  54.52 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 
336 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  52.84 
 
 
327 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  52.27 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  50.63 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  51.92 
 
 
316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  56 
 
 
333 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  55.12 
 
 
339 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  52.13 
 
 
332 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  51.62 
 
 
317 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  50.16 
 
 
316 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  50.8 
 
 
340 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  47.53 
 
 
388 aa  322  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  53.29 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  49.22 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  49.67 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  47.4 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  51.97 
 
 
316 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  49.01 
 
 
365 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  49.67 
 
 
360 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  49.01 
 
 
365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  48.68 
 
 
375 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  49.52 
 
 
364 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  51 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  49.21 
 
 
364 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 
398 aa  305  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  49.03 
 
 
357 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  49.19 
 
 
364 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  45.7 
 
 
382 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  48.37 
 
 
322 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  46.91 
 
 
320 aa  291  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  44.14 
 
 
345 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  46.75 
 
 
360 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 
404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  49.5 
 
 
301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  47.19 
 
 
330 aa  288  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  49.36 
 
 
340 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  45.66 
 
 
327 aa  285  9e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  45.94 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  44.14 
 
 
362 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  45.3 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  50.81 
 
 
311 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  44.51 
 
 
165 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  31.25 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
482 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  27.71 
 
 
434 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  23.13 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  51.52 
 
 
73 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  29.31 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  28.74 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  28.16 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0713  hypothetical protein  26.11 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00301972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3323  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.27 
 
 
344 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  33.33 
 
 
357 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.23 
 
 
342 aa  42.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>