96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4062 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
327 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  55.23 
 
 
335 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  54.69 
 
 
321 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  54.69 
 
 
336 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  54.69 
 
 
336 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  53.29 
 
 
336 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  56.54 
 
 
336 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  54.81 
 
 
314 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  55.12 
 
 
328 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  53.07 
 
 
316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  52.81 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  56.61 
 
 
311 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  52.27 
 
 
340 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  54.4 
 
 
317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  51.09 
 
 
336 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  54.07 
 
 
317 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  55.25 
 
 
311 aa  348  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  52.88 
 
 
333 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  55.12 
 
 
341 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  52.26 
 
 
316 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  50.47 
 
 
339 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  50.16 
 
 
398 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  55.18 
 
 
316 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  49.38 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  53.51 
 
 
308 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  53.51 
 
 
308 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  53.51 
 
 
335 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  53.51 
 
 
308 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  53.51 
 
 
308 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  53.18 
 
 
335 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  53.18 
 
 
335 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 
364 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  51.46 
 
 
310 aa  330  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  51.84 
 
 
308 aa  329  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  52.84 
 
 
308 aa  328  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  52.17 
 
 
308 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  49.69 
 
 
364 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  47.09 
 
 
380 aa  326  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  51.49 
 
 
308 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  48.75 
 
 
357 aa  325  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  51.84 
 
 
308 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  51.84 
 
 
308 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  48.77 
 
 
364 aa  325  7e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  51.84 
 
 
308 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  47.3 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  48.44 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  48.05 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  48.57 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  48.4 
 
 
365 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  47.24 
 
 
375 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  47.37 
 
 
365 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  50.84 
 
 
305 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  44.31 
 
 
388 aa  311  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 
340 aa  311  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  48.21 
 
 
360 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  48.09 
 
 
330 aa  309  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  44.29 
 
 
404 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  48.84 
 
 
308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  43.33 
 
 
345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  47.54 
 
 
327 aa  301  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  43.94 
 
 
362 aa  299  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  48.15 
 
 
301 aa  295  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  43.61 
 
 
320 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  45.15 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  47.94 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
482 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  42.01 
 
 
165 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  30.68 
 
 
245 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  28.81 
 
 
434 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  24.81 
 
 
495 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  43.24 
 
 
73 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.87 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.87 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.87 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.87 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.87 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.68 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.68 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.18 
 
 
342 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.16 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  26.23 
 
 
343 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  26.23 
 
 
343 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.14 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  26.23 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.14 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.23 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  26.23 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.91 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2977  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.05 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.04 
 
 
348 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0597  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.12 
 
 
341 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  25.93 
 
 
353 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  25.24 
 
 
277 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  28.57 
 
 
278 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.96 
 
 
342 aa  42.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>