73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0134 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 308 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  83.93 
 
 		 364 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  82.74 
 
 		 364 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  80.78 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  75.08 
 
 		 365 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  75.08 
 
 		 375 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  74.75 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  75.08 
 
 		 365 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  74.09 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  61.08 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  56.52 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  57.93 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  59.28 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  57.37 
 
 		 380 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  58.94 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  52.68 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  51.32 
 
 		 316 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  51.51 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  47.28 
 
 		 388 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  50.67 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  53.06 
 
 		 319 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  50.67 
 
 		 311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  48.84 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  50.32 
 
 		 336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  48.21 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  51.49 
 
 		 339 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  47.52 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  47.52 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  47.52 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  50.33 
 
 		 314 aa  298  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  51.78 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  49.34 
 
 		 322 aa  298  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  50.99 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  50.67 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  49.02 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  49.5 
 
 		 317 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  48.48 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  48.32 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  49.67 
 
 		 316 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  49.83 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 335 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  48.49 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  48.49 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  47.4 
 
 		 345 aa  285  5e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 335 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 335 aa  285  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  47.99 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  49.5 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  47.65 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  47.65 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  47.65 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  47.65 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  46.53 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  49.17 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  47.4 
 
 		 362 aa  278  6e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  46.46 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  47.62 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  50.17 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  49.49 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  43.04 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  44.97 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  44.88 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  51.07 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  32.4 
 
 		 482 aa  152  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  28.52 
 
 		 245 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  40.7 
 
 		 165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  28.17 
 
 		 434 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  20.93 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  44.12 
 
 		 73 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  28.44 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>