91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0640 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 311 aa  653    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  92.93 
 
 		 311 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  65.47 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  65.47 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  64.5 
 
 		 308 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  64.82 
 
 		 308 aa  417  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  64.82 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  64.82 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  64.5 
 
 		 308 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  64.82 
 
 		 335 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  64.82 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  62.54 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  62.54 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  62.54 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  62.54 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  62.21 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  63.67 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  59.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  59.93 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  57.42 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  57.74 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  57.42 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  57.28 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  57.37 
 
 		 317 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  55 
 
 		 336 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 316 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  55.77 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  56.09 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  54.66 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  55.73 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  55.25 
 
 		 327 aa  348  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  56.09 
 
 		 341 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  53.42 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  51.29 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  54.07 
 
 		 336 aa  341  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  55.06 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  53.72 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  50.64 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  50.78 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  49.06 
 
 		 375 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  47.68 
 
 		 388 aa  331  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  51.7 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  51.28 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  47.8 
 
 		 382 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  50.64 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  51.15 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  51.31 
 
 		 365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  51.63 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  50.65 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  50.99 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  47.75 
 
 		 380 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  50.33 
 
 		 364 aa  319  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  44.85 
 
 		 404 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  49.33 
 
 		 301 aa  315  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  50.67 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  45.85 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  48.52 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  47.12 
 
 		 320 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  46.15 
 
 		 345 aa  297  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  45.34 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  45.19 
 
 		 362 aa  288  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  47.9 
 
 		 340 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  45.03 
 
 		 319 aa  281  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  51.43 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  44.85 
 
 		 165 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  29.96 
 
 		 245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  26.61 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  23.85 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  44.44 
 
 		 73 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3323  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.1 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0254  hypothetical protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1334  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0584  hypothetical protein  28.4 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13423  normal  0.0805665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  28.7 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  25.25 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  24.4 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  28.57 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  26.8 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1918  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.63 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.45 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.45 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.45 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  26.27 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  29.23 
 
 		 196 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002705  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  30.68 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.588026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.41 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  27.42 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  29.1 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>