94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 336 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  91.96 
 
 		 339 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  71.84 
 
 		 335 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  69.16 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  61.39 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  58.08 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  62.42 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  61.41 
 
 		 316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  61.74 
 
 		 317 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  61.41 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  61.09 
 
 		 316 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  57.51 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  51.09 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  50.66 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  55.3 
 
 		 332 aa  358  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  51.38 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  52.92 
 
 		 314 aa  355  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  52.29 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  56.81 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  52.27 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  56.81 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  51.44 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  51.44 
 
 		 336 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  51.44 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  53.4 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  54.07 
 
 		 311 aa  348  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 		 335 aa  348  8e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  56.15 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  55.48 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  56.15 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  50.14 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  50.9 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  51.27 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  56.11 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 		 308 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  56.15 
 
 		 308 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  52.4 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  55.81 
 
 		 308 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  50.15 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  48.68 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  54.31 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  51.67 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  53.82 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  48.97 
 
 		 364 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  53.89 
 
 		 398 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  48.77 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  49.11 
 
 		 364 aa  328  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  48.77 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  49.23 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  49.07 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  48.9 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  48.02 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  50.84 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  50.62 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  48.58 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  49.2 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  51.78 
 
 		 308 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  45.65 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  46.93 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  48.49 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  42.11 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  53.69 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  32.58 
 
 		 245 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  33.44 
 
 		 482 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  42.6 
 
 		 165 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  31.23 
 
 		 434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  51.47 
 
 		 73 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  23.43 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.47 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.82 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.82 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.82 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.82 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.87 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.52 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.408193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.66 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0721  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.52 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.52 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  26.09 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  27.12 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.53 
 
 		 280 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  32.32 
 
 		 255 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>