85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0008 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  96.81 
 
 		 345 aa  699    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 362 aa  761    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  58.61 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  51.74 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  48.98 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  50.31 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  50.78 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  50.79 
 
 		 316 aa  325  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 		 388 aa  325  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  49.23 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  48.48 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  44.39 
 
 		 404 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  48.6 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  48.3 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  47.84 
 
 		 333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  48.56 
 
 		 336 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  48.58 
 
 		 336 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  47.27 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  44.77 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  45.81 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  45.69 
 
 		 364 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  49.68 
 
 		 365 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  45.45 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  45.88 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  45.71 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  48.24 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  46.09 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  47.94 
 
 		 317 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  44.57 
 
 		 328 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  48.73 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  43.94 
 
 		 327 aa  305  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  49.36 
 
 		 365 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  48.25 
 
 		 317 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  47 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  47.27 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  48.73 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 308 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  46.98 
 
 		 314 aa  300  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  45.45 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  47.92 
 
 		 316 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  45.96 
 
 		 305 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 308 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  44.44 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  44.44 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  45.19 
 
 		 311 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  42.03 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  44.55 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  42.03 
 
 		 336 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  44.27 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  44.14 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  43.48 
 
 		 321 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  47.4 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  40.98 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  42.49 
 
 		 319 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  42.59 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  46.53 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  27.66 
 
 		 245 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  39.01 
 
 		 165 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  26.27 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  23.51 
 
 		 495 aa  87.8  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  48.44 
 
 		 73 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.93 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.97 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  24.84 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3323  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.78 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.67 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  32.94 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  23.19 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  23.19 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  23.19 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  23.46 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  22.84 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  22.84 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  22.84 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>